Les syndromes nerveux infectieux sont un défi diagnostique pour le praticien vétérinaire. De nombreux agents infectieux, virus, bactéries ou protozoaires, peuvent entraîner une inflammation significative du système nerveux central dont la rage, les myélo-encéphalopathies à herpèsvirus 1(MEH), la fièvre de West Nile, la maladie de Borna, les myéloencéphalites à protozoaires (EPM), les encéphalomyélites bactériennes, les neuroborrelioses, la listériose et les méningo-encéphalomyélites équines exotiques. Le choix des analyses de laboratoire se fera en fonction des données épidémiologiques et cliniques, et des tests disponibles qui sont assez peu nombreux en routine.