La colite histiocytaire est une maladie à composante génétique rare qui se traduit par une dysplasie de la muqueuse colique, qui fait l’objet d’une colonisation bactérienne. Elle se manifeste cliniquement par une colite cachectisante. Après confirmation histologique sur biopsies coliques et mise en évidence des bactéries par hybridation in situ en fluorescence (Fish), le traitement de choix repose sur la prescription d’enrofloxacine durant plusieurs semaines. Dans le cas de colite histiocytaire présenté, la souche bactérienne isolée est résistante à l’enrofloxacine. La discussion s’intéresse au traitement mis en place dans le contexte réglementaire d’actualité, aux critères permettant d’effectuer le suivi et au pronostic, cela confronté aux données scientifiques.