BioSellal : des outils performants au service du diagnostic vétérinaire

BioSellal propose des méthodes diagnostiques innovantes en biologie moléculaire, dont la réaction en chaîne par polymérase (polymerase chain reaction ou PCR) en temps réel et le séquençage nouvelle génération (next generation sequencing ou NGS).

Le NGS permet le génotypage, mais aussi le séquençage de génomes complets. Les différences génétiques entre les souches d’un même virus ou d’une même espèce de bactéries peuvent ainsi être mises en évidence. Grâce à cet outil très sensible, la recherche simultanée de plusieurs agents pathogènes sur un même échantillon est également possible, ce qui réduit les coûts. Lors de grands syndromes, un diagnostic étiologique est ainsi réalisable. Enfin, en réponse à la demande sociétale actuelle, l’émergence de nouveaux agents pathogènes peut être mise en évidence et des plans de maîtrise sanitaires et médicaux sont anticipés.

Grâce à cette technique, le laboratoire a notamment séquencé en 2014¹ le génome complet de la souche de l’herpèsvirus bovin de type 4 (bovine herpesvirus 4 ou BoHV-4), isolée dans les élevages de Saône-et-Loire. L’hypothèse d’une souche hypervirulente a pu être formulée par la mise en évidence d’une mutation inconnue dans les souches de référence.

Séquençages de six gènes du PRRSV et du PEDV

BioSellal propose également en routine le séquençage de six gènes du virus du syndrome respiratoire et reproducteur porcin (porcine reproductive and respiratory syndrome virus ou PRRSV), responsable du syndrome dysgénésique et respiratoire du porc (SDRP), et du virus de la diarrhée épidémique porcine (porcine epidemic diarrhea virus ou PEDV). Pour ce dernier, il s’agit du séquençage complet de la partie S1 du gène S du PEDV, reconnue comme la plus représentative de la variabilité de ce virus.

Enfin, des travaux de recherche et de développement sont en cours pour le diagnostic bactériologique des mammites bovines (par PCR), des avortements chez les bovins et des maladies dues aux morsures de tiques.

Cette offre de services s’adresse à de nombreux acteurs : laboratoires de diagnostic vétérinaire, industries pharmaceutique, agroalimentaire ou du diagnostic, organismes de recherche, vétérinaires praticiens et acteurs des filières. Des projets de biologie moléculaire ou des essais de terrain (suivi épidémiologique, validation de réactifs) peuvent également être encadrés par BioSellal.

• 1 Dans le cadre d’un partenariat entre le groupement technique vétérinaire de Bourgogne (GTVB), le groupement de défense sanitaire (GDS 71) et le laboratoire départemental d’analyses vétérinaires de Saône-et-Loire (LDA 71). Voir notre article « Génotypage du BoHV-4 en Bourgogne : un modèle de collaboration réussie », La Semaine Vétérinaire n^os 1610 et 1611 des 19 et 26/12/2014, en page 15.