Fold-it détermine la structure des protéines - La Semaine Vétérinaire n° 1463 du 23/09/2011
La Semaine Vétérinaire n° 1463 du 23/09/2011

Biochimie

Actu

RECHERCHE

Auteur(s) : STÉPHANIE PADIOLLEAU

Le repliement des protéines est étudié grâce à un jeu sur Internet. La structure spatiale d’une protéase virale ainsi décryptée offre une meilleure compréhension des rétrovirus.

L’université de Washington a développé un jeu sur Internet destiné à aider les chercheurs dans l’étude des protéines, plus particulièrement sur leur repliement tridimensionnel, d’où son nom, Fold-it1. La version bêta, en ligne depuis 2008, offre à tout joueur la possibilité de résoudre des puzzles en trois dimensions de protéines connues, pour s’entraîner. Un score est accordé à chaque structure trouvée par le participant, fondé sur la comparaison avec la molécule connue ou par calcul à partir des logarithmes de prédiction des structures protéiques utilisés en biochimie. Lorsque les joueurs deviennent plus chevronnés dans le maniement des outils du jeu, ils peuvent alors interagir entre eux sur des protéines plus complexes ou dont le repliement est inconnu. Les propositions ayant le plus haut score sont ensuite analysées par les scientifiques responsables du projet.

La revue Nature vient de publier une courte communication2 à la suite de travaux sur une protéine virale. La structure tridimensionnelle de la protéase du virus du singe Mason-Pfizer (rétrovirus intervenant dans le syndrome d’immunodéficience acquise du singe rhésus) a ainsi été déterminée par le “travail” combiné de plusieurs joueurs de Fold-it, alors qu’elle tenait en échec les scientifiques depuis plus de 10 ans. Les concurrents ont donc réussi là où les méthodes automatisées classiques ont échoué, sans avoir de formation scientifique préalable. La connaissance de la structure tridimensionnelle des protéines virales devrait faciliter la recherche de traitements antiviraux, particulièrement contre le VIH.

En plus d’un intérêt strictement scientifique, ce système qui intègre le jeu vidéo multijoueur dans les méthodes de recherche montre les limites du traitement automatisé des données versus les capacités combinées de cerveaux humains.

  • 1 http://fold.it/

  • 2 Khatib F, DiMaio F, Cooper S, Kazmierczyk M, Gilski M, Szymon Krzywda, Zabranska H, Pichova I, Thompson J, Popovic Z, Jaskolski M et Baker D : “Crystal structure of a monomeric retroviral protease solved by protein folding game players”, Nature Structural & Molecular Biology, 2011, publié en ligne le 18/9/2011.

Formations e-Learning

Nouveau : Découvrez le premier module
e-Learning du PointVétérinaire.fr sur le thème « L’Épanchement thoracique dans tous ses états »

En savoir plus

Boutique

L’ouvrage ECG du chien et du chat - Diagnostic des arythmies s’engage à fournir à l’étudiant débutant ou au spécialiste en cardiologie une approche pratique du diagnostic électrocardiographique, ainsi que des connaissances approfondies, afin de leur permettre un réel apprentissage dans ce domaine qui a intrigué les praticiens pendant plus d’un siècle. L’association des différentes expériences des auteurs donne de la consistance à l’abord de l’interprétation des tracés ECG effectués chez le chien et le chat.

En savoir plus sur cette nouveauté
Découvrir la boutique du Point Vétérinaire

Agenda des formations

Calendrier des formations pour les vétérinaires et auxiliaires vétérinaires

Retrouvez les différentes formations, évènements, congrès qui seront organisés dans les mois à venir. Vous pouvez cibler votre recherche par date, domaine d'activité, ou situation géographique.

En savoir plus


Inscrivez-vous gratuitement à nos Newsletters

Recevez tous les jours nos actualités, comme plus de 170 000 acteurs du monde vétérinaire.

Vidéo : Comment s'inscrire aux lettres d'informations du Point Vétérinaire

Retrouvez-nous sur
Abonné à La Semaine Vétérinaire, retrouvez
votre revue dans l'application Le Point Vétérinaire.fr